Określenie "drobnoustroje" nie jest jasne dla wszystkich. Wiele osób uważa, że drobnoustroje to to samo, co bakterie, lub że bakterie są groźniejsze od drobnoustrojów. Nie jest to prawda.
Słowa "drobnoustrój" używa się do określenia wszystkich potencjalnie szkodliwych mikroorganizmów, czyli bakterii, wirusów, przetrwalników bakteryjnych, pleśni i grzybów.